Wskazaniem na leczenie kanałowe są przede wszystkim spore ubytki, głęboka próchnica, martwica miazgi, złamanie zęba, a także w niektórych przypadkach protetycznych leczenie może być zastosowane jako przygotowanie do założenia korony lub mostu.
W dużym uproszczeniu leczenie kanałowe pod mikroskopem polega na usunięciu martwej i zainfekowanej miazgi zęba z komory oraz z kanału korzeni zębowych. Stomatolog musi mechanicznie i chemicznie oczyścić oraz poszerzyć kanały korzeniowe na całej ich długości. Czynność ta wykonywana jest za pomocą specjalnych narzędzi kanałowych. Kiedy kanał zostanie już oczyszczony pozostaje wypełnienie go specjalnym materiałem. Należy pamiętać, że w niektórych przypadkach kiedy występuje przewlekła infekcja wokół wierzchołka zęba, potrzebna będzie resekcja korzenia, która jest osobną procedurą.